据台湾《联合报》的消息，从11月1日开始，台湾军队原属于军团级的金门防卫司令部正式降为军级的指挥部，而首度在金门成立了地区守备队的编制，金防部的各作战部队，从师级降为旅级，金门的兵力只剩下几千人。在金防部大缩编之后，台湾军队的陆军一共不够10万人。而在两蒋时代，单是金防部，兵力就超过10万人。1990年还有两万五千人。金门距离大陆的厦门最近的地方只有2.3公里，距离台湾本岛将近280公里，金门的地理位置特殊，一度是两岸军事对峙的最前沿阵地。台军在陈水扁决战境外的军事理念之下，外岛成为台湾军队计划反制、先制的作战平台。

目前台湾军队的理念，是要把兵力收拢为台湾本岛 

，确保本岛缩减金马的驻军，但不全部撤兵。持续在外岛部署先进的远程攻击武器，并且扬言火力可以提高1.5倍。有报导说，台湾可能会把最先进的雄风二E导弹部署在金门岛。兵力虽然减少了，但是加强了对大陆纵深打击的威慑力。有香港的军事评论员认为，外岛对于本岛的防御作战有预警和争取更大的防御纵深的作用，而陈水扁企图用军事行动配合台独的政策，加快推动去中国化的进程。陈水扁指示军方在金门撤军，并不是要向中国大陆示好，而是有意脱离接触减少外岛的负担，甚至在必要的时候舍弃金门马祖岛，固守台湾岛，妄图造成海峡两岸一中一台或者一边一国的政治和军事的企图。

董嘉耀：台湾在金门进行所谓大撤军，到底有什么考量呢？我们请到台北方面的军事观察员亓乐义先生来分析一下，亓先生，以你的观察，你觉得应对中国大陆目前的军事的压力，台湾这个金门撤军到底有什么军事考量？

亓乐义：是这样子，十几年前，台湾的党外就已经提出了这个金马全面撤军，那时候已经提出来，希望能够建立两岸军事缓冲区。后来参谋本部有做研究，发现这个不可行。因为到时候我们撤出来，万一金门有问题，我们再回防的时候，会回防不及。所以这个案子十几年就提。那为什么现在又撤军呢？是因为当年的固安作战计划是把"反攻大陆"作为我们的作战任务之一，所以这些外里岛可以扮演一个反攻大陆的跳板的角色。但现在这个固安计划已经修正了，所以已经不"反攻大陆"了。所以要不要保持这么多的兵力在海外？这是当时已经提出质疑，所以兵员的降低是必然。

还有一个最重要的，就是解放军的现代化发展很快，金马这些地方都已经在解放军的活力覆盖范围之内，所以把那么多的主力部队放外面，就意味着人越多伤亡会越大，也没有必要。再加上现在的地下化、网络化已经做得已经到位，所以也不需要这么多的兵力。

它在军事上的作用倒是有一个，就是说万一有一天解放军能够越岛登台的时候，这些外里岛可以扮演这个侧翼跟后翼的一个袭扰的角色。那解放军为了要顺利地能够越岛登台的话，必须要分散它的兵力作为一些火力的封锁或兵力的封锁这些外里岛，也可以分散这个解放军的兵力，所以在军事上也是有它的意义存在的。

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